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办理集体土地建设使用证（宅基地使用权），能不能办理房产证（房屋所有权）？答案不容置疑：完全可以。
1、《不动产登记暂行条例实施细则》（下文简称《细则》）第四十条第二款：“依法利用宅基地建造住房及其附属设施的，可以申请宅基地使用权及房屋所有权登记。”之规定，可以看出依法取得宅基地使用权后可以办理宅基地上房屋所有权登记。
2、《细则》第四十一条：“申请宅基地使用权及房屋所有权首次登记的，应当根据不同情况，提交下列材料：
（一）申请人身份证和户口簿； （二）不动产权属证书或者有批准权的人民政府批准用地的文件等权属来源材料； （三）房屋符合规划或者建设的相关材料（四）权籍调查表、宗地图、房屋平面图以及宗地界址点坐标等有关不动产界址、面积等材料；（五）其他必要材料。”之规定，可以看出首次登记宅基地上房屋所有权需要申请人提供的材料。
3、《细则》第四十二条：“因依法继承、分家析产、集体经济组织内部互换房屋等导致宅基地使用权及房屋所有权发生转移申请登记的，申请人应当根据不同情况，提交下列材料：（一）不动产权属证书或者其他权属来源材料； （二）依法继承的材料； （三）分家析产的协议或者材料： （四）集体经济组织内部互换房屋的协议； （五）其他必要材料。”之规定，可以看出特殊情况下，如何办理宅基地上房屋所有权所需要提供的材料。
★申请共有不动产登记的，不动产登记机构向全体共有人合并发放一本不动产权属证书；共有人申请分别持证的，可以为共有人分别发放不动产权属证书。 共有不动产权属证书应当注明共有情况，并列明全体共有人。
综上所述法律规定，那么可以明确的肯定依法取得了宅基地使用权后可以办理宅基地房屋所有权证的。当然具体办理程序要到当地所属不动产登记机构进行咨询。
笔者作为“乡杆杆”，在乡镇具体从事农房管理工作多年，特来作答。
集体土地使用证，只能说明建房时宅基地办理过相关审批手续，而要办理房屋产权证，原则上需要集体土地使用证（即宅基地证）、乡村建设规划证两齐全，且经现场查验所占宅基地、所建房屋与两证上的情况大体一致，才能办理。
对于只有集体土地使用证的农房而言，要办理产权证，通常重点需注意两方面的问题：（1）建房所占土地是否与集体土地使用证的情况大体一致；（2）在宅基地无大的问题之下，补办乡村规划建设手续。
因此，具体可按下列程序办理房产证：
第一步，请当地国土所工作人员到现场查看宅基地是否与集体土地使用证上审批的情况一致。若存在严重的批少建多、批后乱占乱建（比如批甲建乙、移位、占用基本农田等），则该集体土地使用证已无实际效力。若大体一致，没有占用基本农田，也基本没超占宅基地面积，这才能进入第二步的程序。
第二步，补办乡村建设规划手续。只要宅基地没有问题，这里只需到乡镇的村建办填表补办规划手续即可。
第三步，提供集体土地使用证、乡村建设规划手续、户口本等相关资料，办理房产证。
